U ljudskom tijelu pronađen je super-raširen virus, o kojem do danas nismo znali

Znanstvenici su upravo najavili otkriće novog, nevjerojatno čestog virusa koji živi unutar crijevnih bakterija. To se naziva "crAssphage" i gotovo je šest puta češće nego svi drugi bakterijski virusi zajedno. Ali kako ga ne bismo mogli tako dugo primijetiti?

Razlog zbog kojeg prije nismo pronašli crasfag je da nismo znali da ga trebamo tražiti. To znači.

Iako nove tehnologije sekvenciranja postaju sve brže i jeftinije, još uvijek imaju jednu slabost: dobre su u pronalaženju stvari za koje već znamo, ali nisu dobre u pronalaženju novih organizama. Kada istraživači proučavaju organski uzorak, iz fragmenta DNA dobiju juhu svih živih bića vezanih uz ovaj uzorak - bakterije, viruse i osobu. Tada se ti fragmenti moraju sastaviti u sekvence koje možemo identificirati. Ako pronađemo lanac specifičan za genom određene bakterije, to znači da smo pronašli ovu bakteriju u uzorku..

Problem je u tome što, ako još ne znamo slijed nepoznatog virusa, ne možemo ga otkriti pomoću ove tehnike. Zapravo, autor nove studije krasfage, Bass Datil, izvješćuje da su oni nepoznati gotovo 75 posto DNA sekvenci u uzorcima koje su proučavali..

Tim Datila uspio je pronaći novi virus koristeći potpuno drugačiji pristup koji se temelji na jednostavnoj ideji: fragmenti koji se uvijek iznova pronalaze u istom uzorku vjerojatnije su dijelovi istog genoma. Oni su koristili tehniku ​​tzv. Cross-assembly za identificiranje jedne takve skupine ponavljajućih sekvenci u uzorcima uzetim od 12 osoba. Zatim su ove sekvence sastavili u jedan genom..

I dobili su upravo to: virus crAssphage, nazvan po tehnici ukrštanja koja je dovela do njezina otkrića. Otkrili su da crAssphage živi u Bacteroidesu - zajedničkoj skupini bakterija koje žive u našim crijevima..

Kao rezultat istraživanja, tim je pronašao crasfage u 75% intestinalnih sekvenci ljudi u SAD-u, Europi i Južnoj Koreji. Još ne znamo što točno ti fagi rade u našim crijevima, ali oni definitivno imaju određenu ulogu u našem crijevnom mikrobnom ekosustavu..

I na kraju, zanimljiva činjenica: znanstvenici su izračunali da u našem tijelu ima otprilike 100 puta više virusnih čestica od ljudskih stanica. Dakle, još uvijek imamo puno posla kako bismo shvatili što zapravo jesmo..